核酸外切酶 III来源于E.coli,具有3'-5'外切酶活性,它作用于双链 DNA,从 3' OH 末端方向逐步切去单核苷酸;每次酶与底物结合催化,只有几个核苷酸被除掉,从而在 DNA 分子群内产生渐进缺失。该酶的最佳底物为平末端、5'突出末端双链DNA分子,但也可作用于双链DNA的缺刻处,从3'降解DNA分子,释放5'单核苷酸。对于3'突出末端,尤其是多于4nt的几乎完全不切割, 亦不能切割硫代磷酰脂键。核酸外切酶 III 的活性部分依赖螺旋结构,并根据序列的不同而有差异(C>A=T>G)。另外,核酸外切酶 III还具有脱嘌呤/嘧啶-核酸内切酶活性、RnaseH活性和3' 磷酸酶活性。 |
组分 |
名称 | 数量 | Exonuclease III (100 U/μl) | 50 μl | 10X Exonuclease III Buffer | 1 ml | |
应用 |
- 非定向巢式缺失
- 定点突变
- 链特异性探针的制备
- 制备用于双脱氧测序的单链底模板
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单位定义 |
50 μl 反应体系中,37℃ 条件下,30 分钟 催化E.coli DNA 产生 1 nmol 酸可溶性产物所需要的 量定义为一个活性单位。 |
1X Exonuclease III Buffer |
10 mM Bis-Tris(pH 7.0),10 mM MgCl2,1 mM DTT。 |
热失活 |
70°C 20min。 |
储存 |
置于-20°C,可保存3年。 |
实例 |
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Fig 1:分别用不同的内切酶切质粒DNA产生5'突出末端、平末端和3'突出末端产物,然后用Exonuclease III(2.5U)分别酶切这三种产物(5 μg),将酶切产物琼脂糖电泳。泳道1:5'突出末端产物;泳道2:平末端产物;泳道3:3'突出末端产物;M:DNA Marker 10000。 | ? | Fig 2:EcoR V酶切pUC57质粒获得酶切产物,然后分别用不同量的Exonuclease III酶切该产物获得渐进缺失产物。泳道1:对照(不加Exonuclease III); 泳道2:0.312U Exonuclease III; 泳道3:0.625U Exonuclease III; 泳道4:1.25U Exonuclease III; 泳道5:2.5UExonuclease III; M:DNA Marker 10000。 |