描述:RAPA3G DNA 聚合酶为经电子重构架的第三代 Taq DNA 聚合酶,第三代 DNA 聚合酶具有高度的杂质耐受性、 长片段扩增能力、高扩增成功率、高产量,这些特点使得 RAPA3G 系列产品可用于粗制样品的直接扩增,无需核酸纯 化步骤。 该 PCR Mix 具有 5’-3’的聚合酶活性、 5’-3’的外切 酶活性、3’-5’的外切酶活性,产物部分带有”A“尾巴,部 分为平末端,因此产物可用于 TA 克隆或平端克隆。
特点和用途:
(1)高杂质耐受性:该 PCR Mix 可直接使用多糖多酚含量 极高的叶片等材料进行 PCR 扩增,无需基因组提取。
(2) 高效的快速 DNA 释放剂:尽管该 PCR Mix 可以直接 使用叶片进行扩增,但我们仍然推荐采用 DNA 释放剂进行 样本的快速前处理(约需要 5min,可高通量操作)。DNA 释 放剂的前处理, 使得制备的 DNA 模板可以进行多次、多基 因扩增, 并长期保存植物 DNA,经 DNA 释放剂处理的样本, 在室温条件下放置 1 个月, 无任何后续影响,-20 可长期保 存。
(3) 快速 PCR:该酶具有 6kb/min 以上的扩增速度,可 显著的缩短 PCR 的扩增时间,在常规测试条件下,10s 的 延伸时间可完成 1kb 的基因组 DNA 扩增。
(4) 粗制样品的扩增能力:扩增能力>1.7kb。
(5) 高保真性能:该制品包含一定比例的 RAPA HiFi 超保 真 DNA 聚合酶, 因此其具有一定的保真性能(经蓝白斑测 试,其保真性能约为 Taq DNA 聚合酶的56 倍)。
(6) 热启动, 防止非特异性扩增: RAPA3G 系列产品均采 用 HaiGene 专有的热启动技术,确保 50 度以下完全无活性, 仅有 95 度加热 5min 以后才能恢复其活性,因此可最大限度 的提高扩增的特异性, 减少非特异性产物的产生。
包装:
2×RAPA3G PCR Mix (with Dye) 快速 DNA 释放剂 A 快速 DNA 释放剂 B | 1mlX2 20 ml 20 ml |
注意:2×RAPA3G PCR Mix (with Dye)制品可单独订购,货 号, A0607。
储存: 长期储存置于-20°C 以下,可保存 2 年;短期使用置 于 4°C (3 个月)保存。
使用方法
1. DNA 释放
(1)采用加热法:取 2-3mm 直径叶片(白 Tip 头上沿大小)、 1- 10mg 果实等材料, 放入到 0.2ml EP 管中, 加入 50 pl 快 速 DNA 释放剂 A,于 PCR 仪中98°C 加热 5min,加热完毕 后加入 50 pl 快速 DNA 释放剂 B,混合均匀,即可使用。
(2) 采用钢珠研磨法:取 2-3mm 直径叶片、 1- 10mg 果实 等材料, 放入到 2ml EP 管中,加入 250 pl 快速 DNA 释放 剂 A 和 2-3 粒钢珠,研磨 1-2min 成浆体装。 研磨完毕后加 入 250 pl 快速 DNA 释放剂 B,混合均匀,即可使用。
2. 按下表配制 PCR 反应体系并混合均匀: 2×RAPA3G PCR Mix (with Dye) 25 pl
上游引物(10 pM)
下游引物(10 pM)
步骤 1 制备的模板 DNA 2 pl
ddH2O
注意:当扩增片段>5kb 时,引物用量调整为 0.25-0.5pl。
3. PCR 扩增循环参数
循环数 | 温度 | 时间 |
预变性 | 95°C | 5min |
| 95°C | 20s |
25-40 Cycles | 50~60°C 72°C | 20s 4-6kb/min |
末延伸 | 72°C | 2min |
请注意:(1) 该制品为热启动制品预变性步骤 5min 不可缩 短,否则 DNA 聚合酶无法恢复活性。(2) 当扩增片段<1kb 时, 延伸时间使用 15s;扩增片段 1-2kb 时,延伸时间使用 45s ,扩增片段 2-3kb 时,延伸时间使用 1min ,当扩增片 段>3kb 时,请按照 2kb/min 的延伸时间进行设置。(3)尽管 该酶具有 6kb/min 的延伸速度, 但按照 2kb/min 设置延伸时 间的条件下,能获得最高的产量。
3. 注意事项: (1) 当模板 GC 含量>70%时,请添加
5× Q-Solution (Cat. No.: A3002) 。(2)当采用全血、血浆等 蛋白含量极高的样本时, 扩增完毕后可能会有变性的蛋白沉
淀,请离心后再进行点样和电泳。