使用方法
下面的操作步骤是针对在 1.5 mL 塑料离心管中进行的微量提取的,如果处理样品量大,请按比例增加各成份的用量并使用大的离心管和离心机。
1. 根据组织细胞类型的不同分为下面及种情况使用:
a) 对贴壁细胞:吸尽培养液,在每 10 平方厘米细胞中加入 1 mL 柱式动物RNAout 溶液 A,用枪轻柔吹打数次,确保细胞全部裂解并且让基因组DNA 充分断裂。
b) 对悬浮细胞:离心收集细胞,吸尽液体,在每 1-5×106悬浮细胞中加入1 mL 柱式动物 RNAout 溶液 A,用枪轻柔吹打数次,确保细胞全部裂解并且让基因组 DNA 充分断裂。如果是 fibroblasts 或 carcinoma cell,1 mL 溶液 A 的细胞使用量不要超过 1×106个细胞。
c) 对新鲜组织:先将剪切成小块新鲜组织或液氮保存的组织放入 10 mL 或15 mL 塑料离心管中,每 50-100 mg 组织加 1 mL 柱式动物 RNAout溶液 A,用 Polytron 剪切式匀浆器匀浆 30 秒左右。对肝、脾、胰、肾等细胞分裂十分旺盛的组织(细胞中含大量正在复制的 DNA),建议组织的使用量不要超过 50 mg/ mL 柱式动物 RNAout 溶液 A,否则十分容易产生 DNA 污染。也可以用液氮研磨:在研钵中加入液氮,再加入 50-100mg新鲜组织,然后研磨粉后转移到 1.5mL 离心管中,再加入 1mL 柱式动物 RNAout 溶液 A,震荡 30 秒混匀。
d) 对 RNALOCKER 保存组织:先用纸吸去 RNALOCKER 液体后再剪切成小块,其余操作同新鲜组织的处理。
2. 如果进行无氯仿操作(所得 RNA 纯度稍低,但一般不影响后续使用),则将上步所得的细胞裂解物或匀浆液转移至一个干净的 1.5 mL 塑料离心管中,12,000 rpm 室温离心 3-5 分钟。
3. 如果进行带氯仿操作(所得 RNA 纯度比免氯仿操作稍高),则将上步所得的细胞裂解物或匀浆液转移至一个干净的 1.5 mL 塑料离心管中,然后加入0.2倍体积的自备氯仿(1 mL柱式动物RNAout溶液A需0.2 ml氯仿),振荡器充分振荡混均 30 秒,12,000 rpm 室温离心 3-5 分钟。
4. 将上清液转移到一个干净的 2 mL 塑料离心管中。注意:无氯仿操作时,离心后管底是细胞碎片和结缔组织纤维。带氯仿操作时,离心后分上下层,下层有机相和上下层中间含有 DNA 和蛋白质,吸取上清时避免触及,否则将产生蛋白质和 DNA 污染。为保险起见,可以留下 100 uL 上清液不取。同时吸取上清时最好缓慢进行。
5. 加入等体积的柱式动物 RNAout 溶液 B,充分颠倒混匀。
6. 分次(一般需要 2-3 次)将加入柱式动物 RNAout 溶液 B 后的混合液转移到离心吸附柱中,12,000 rpm 室温离心半分钟,弃穿透液。如果溶液粘稠,可以延长离心时间到 2 分钟。
7. 加 0.7 mL 通用洗柱液到离心吸附柱中,12,000 rpm 室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。一次洗涤一般足够去除杂质。
8. 再加 0.3 mL 通用洗柱液到离心吸附柱中,12,000 rpm 室温离心半分钟,弃穿透液。此步可以省略。
9. 再室温 12,000 rmp 干甩半分钟。此步十分重要,否则残留的通用洗柱液会影响 RNA 的使用。
10. 将离心吸附柱转移到一自备的 RNase-free1.5mL 塑料离心管中,加入50-100 uL RNA 洗脱液。
11. 室温 12,000 rmp 离心半分钟,离心管中溶液即为 RNA 样品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
12. RNA 的电泳检测:本试剂盒提取的 RNA 最好用甲醛变性胶电泳,如果在非变性的普通琼脂糖胶(in TAE 或 TBE buffer)上电泳,一定要使用RNA 专用上样液 RNAon(操作详见 RNAon 使用手册),千万不要使用常用的 DNA 上样液,因为 DNA 上样液没有经过去 RNase 处理,也不能将 RNA 变性,得到的带型将十分杂乱。
13. RNA 完整性的电泳检测:如果需要做 Northern 杂交,强烈建议用户使用甲醛变性胶进行 RNA 电泳,因为非变性胶不能分离所有的 RNA 分子(BioTechniques,28:414,2000)。
14. RNA 产量产率测定:将 5-10 μL RNA 溶于 TE 缓冲液中(pH7.5-8.2 之间)检测其在OD260的光吸收。通过光吸收可以得出RNA浓度(1 OD260的 RNA=40 μg/mL),进而计算出 RNA 的产量(浓度 X 体积)和产率(RNA产量/组织用量)。
15. RNA 纯度测定:无污染的总 RNA 的 OD260/OD280 一般在 1.8-2.1 之间(具体数值与其碱基组成和溶液成分等多种因素有关),高于此范围则分别表示样品可能有蛋白质污染,但一般不影响 RT-PCR 等反应。