节杆菌通用探针法荧光定量PCR试剂盒具有下列特点:
1.即开即用,用户只需要提供 DNA 模板。
2.引物根据 EB 病毒专一区设计,特异性高。
3.荧光定量PCR 检测,比常规 PCR 更加灵敏。
4.一管式闭管操作,降低了交叉污染。
5.本试剂盒足够 50 次 20μL 反应体系的荧光定量 PCR。
本产品只适用于科研,不能用于临床诊断
成分 | 十孔盒包装 |
2×qPCR Magic Mix | 500 μL(棕色管) |
荧光PCR 专用模板稀释液 | 1 mL(黄盖) |
病毒染料法 qPCR 引物混合液 | 100 μL(白盖) |
病毒染料法 qPCR 阳性对照 (1×10E8 拷贝/μL) | 50 μL(黄盖) |
使用手册 | 1 份 |
运输及保存:低温运输、-20℃保存,有效期一年。
自备试剂:DNA 模板、超纯水、10×ROX(根据机型决定,具体见使用方法)。
使用方法 一、稀释 PCR 阳性对照(以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例)
1. 注意:由于阳性对照浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供可以直接使用的 DNA 片段作为阳性对照。
2. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
3.用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液(最好用带芯枪头,下同)。
4.在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照,充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
5.换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),
充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
6.换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照到 5 号管中,充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
7.重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的阳性对照。放冰上待用。二、样品 DNA 的制备
8.如果有 N 个样品,必须设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),
一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL PCR 阳性对照的 10000 倍稀释的(稀释后浓度为 1×10E4 拷贝/μL,10μL 相当于 1 万拷贝,可以将 10μL 原液加入到 990μL 自备 TE 溶液中,充分混匀,此为 100 倍稀释液。再取 10μL 此稀释液加入到 990μL 自备 TE 溶液中,充分混匀,此为 10000 倍稀释液)再加上一定量的水作为制备的阳性对照(加水后其总体积跟样品一样,样品体积多少取决于所用试剂盒的要求)。可以用水作为制备的阴性对照。制备所得成为样品 DNA。
9.用自选方法纯化 N+2 个样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数核酸提取试剂盒兼容。
三、设置 qPCR 反应(20 μL 体系,在样品制备室进行)
10.如果做定量分析并且只做 1 次重复,则标记 N+9 个PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照,6 个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1 次重复,则标记 N+4 个PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的N+2 个样品,1 个用于PCR 阴性对照(用水做模板),1 个用于PCR 阳性对照(用第 4 号阳性对照稀释液,浓度为 14810 拷贝/μL)。下面只描述定量分析的步骤, 定性分析只是把 6 个标曲反应缩减成 1 个,其余不变。
11.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕
后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加)
成分 | 样品管 N+2 个 | PCR 阴性 对照管 | PCR 阳性 对照管(2-7 管) |
2×qPCR MagicMix | 10 μL | 10 μL | 各 10 μL |
染料法qPCR 引物混 合液 | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
自备 10×ROX (见注) | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
N+2 待测样品 cDNA 模板 | 6 μL | - | - |
自备超纯水 | - | 6 | - |
第 7 步所得 PCR 阳性对照稀释液(2-7 号) | - | - | 各 6μL(2 号样到 2 号管,3 号样到 3 号管…) |
注:仅 ABI7500、7700 和 7900 仪器需要使用ROX 作为对照,其他荧光 PCR 仪器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480)不需要使用 ROX,则用水替代。
12. 盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR(具体 PCR 参数可以根据仪器不同而自行优化)。
四、数据处理
13.如果把节杆菌通用探针法荧光定量PCR试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,
以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 cDNA 浓度的log 值,再推算出其浓度。
14.如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大于或等于 36。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 34 则为阴性,如果小于或等于 30 则为阳性。如果在 30-34 之间,则重复一次。若重复结果 Ct 值小于 34,扩增曲线有明显起峰,该样本判断为阳性,否则为阴性