产品及特点
支原体和亲缘关系很近的无胆甾原体、螺旋体统称霉形体。霉形体是目前发现的最小的、最简单的原核生物。它们缺乏细胞壁、有变形能力、能通过滤菌器、 可在无生命培养基中生长繁殖,成为细胞培养中常见的一种污染源,严重影响细胞生长率、细胞形态、基因表达、细胞代谢和细胞活力。因此快速灵敏检测支原体具有重要意义。本产品就是为此目的根据 PCR 原理开发的试剂盒,它具有下列特点:
1.即开即用,用户只需要提供样品 DNA 模板。
2.引物和探针经过优化,灵敏性高。
3.提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4.特异性高,引物是根据支原体高度保守区设计,不会跟其他微生物的 DNA 发生交叉反应。
5.本产品足够 50 次 20μL 体系的探针法荧光定量 PCR 反应。
6.本产品只能用于科研。
成份 | 编号 | 十孔盒包装 |
PCR MagicMix 3.0 | 90805 | 1 mL(红盖) |
超纯水 | 100935 | 1 mL(亮黄盖) |
支原体通用 PCR 引物混合液 | 13-74000yw | 100 μL(白盖) |
支原体通用 PCR 阳性对照 (1×10E8 拷贝/μL) | 13-74000pc | 50 μL(黄盖) |
运输及保存:低温运输,-20℃保存,保存期限为 12 个月。
自备试剂:样品 DNA。
使用方法:
一、稀释标准曲线样品(以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例)。
由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原, 本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的 DNA 片段作为阳性对照。
1.标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
2.用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
3.在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
4.换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用
5.换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用
6.重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。二、样品 DNA 的制备
7.如果有 N 个样品,最好设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL 阳性对照的 10000倍稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为PC。另外用水作为 NC。
8.用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数 DNA 提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的核酸释放剂,使用后其裂解液可以直接作为 PCR 模板,省略了 DNA 提取步骤。
三、Probe qPCR 反应(20μL 体系,在样品制备室进行)
9.如果做定量分析并且只做 1 次重复,则标记 N+9 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),6 个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1 次重复,则标记 N+4 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品,1 个用于 PCR 阴性对照(用水做模板),1 个用于 PCR 阳性对照(用第 4 号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设 置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好
后最后加):
成分 | N+2 个 样品管 | PCR 阴性 对照管 | PCR 阳性 对照管 |
PCR MagicMix 3.0 | 各 20 μL | 20 μL | 20 μL |
支原体通用 PCR 引物混合液 | 各 2 μL | 2 μL | 2 μL |
N+2 个样品 DNA 模板 | 各 18 μL | - | - |
PCR 阴性对照(超纯水) | - | 18 μL | - |
PCR 阳性对照(支原体通用 PCR 阳 性对照的 10000 倍稀释液) | - | - | 18 μL |
12.盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR:
过程 | 温度 | 时间 |
预变性 | 95℃ | 5 min |
PCR 反应 (35 个循环) | 95℃ | 30 sec |
| 55℃ | 30 sec |
| 72℃ | 60 sec |
最后延伸 | 72℃ | 10 min |
四、数据处理
12.如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品RNA 浓度的 log 值,再推算出其浓度。
13.如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大于或等于 34。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 34 则为阴性,如果小于或等于 30则为阳性。如果在 30-34之间,则重复一次。重复实验的 Ct值,如果大于或等于 34 则为阴性,如果小于 30,则为阳性。