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Universal miRNA Cloning Linker (5′腺苷化3′封闭)
产品名称:
Universal miRNA Cloning Linker (5′腺苷化3′封闭)
英文名称:
Universal miRNA Cloning Linker
产品类别:
科研试剂
产品编号:
R0702S
产品编号:
R0702S
  • CAS号 :R0702S
  • [价格]
    规格 价格 库存
    1?g ¥ 518 200
    5?g ¥ 1980 200

    产品详情

     Universal miRNA Cloning Linker (5´腺苷化3´封闭),即通用miRNA克隆接头(5´腺苷化3´封闭)或Universal miRNA Cloning Linker (5'adenylated, 3'blocked),是一种常用于miRNA等3’端为羟基的RNA或3’端为羟基的单链DNA在克隆、高通量测序建库或PCR检测等时,在3’端添加的接头。

    本产品5´端腺苷酰化(也称5´端预腺苷酰化或5´端预腺苷化,5′ pre-adenylated或5′ pre-adenylation),3´端氨基封闭,可以用于3’端为羟基的RNA的3’端接头的添加。RNA连接酶可以识别“活化”的5´端腺苷酰化的本产品,在无需ATP存在的条件下,可将本产品的5´端与另外一条单链寡核苷酸的3´端羟基共价连接。利用5´端腺苷酰化,3´端封闭的本产品,加入RNA连接酶,在无需添加ATP的条件下,就能实现本产品5’端和目标序列3’羟基的特异性共价连接。例如和miRNA连接时,可以有效避免miRNA的自连、不同miRNA之间的连接、本产品的自连或本产品不同链之间的连接,而仅发生本产品5’端和miRNA 3’羟基之间的特异性连接。

    本产品的电泳图和连接效果图请参考图1。图中可见,本产品条带清晰,纯度高,与5’端为磷酸化的序列相比有显著的电泳迁移率差异(图1A);并且本产品使用T4 RNA ligase 2 (T4 Rnl2), truncated与ssRNA连接时,连接效率非常高(图1B)。

    图1. Universal miRNA Cloning Linker Linker (5´腺苷化3´封闭)及其连接效果图图。图A. 本产品5´-rAppCTGTAGGCACCATCAAT–NH2-3´ (AppDNA)与5´-pCTGTAGGCACCATCAAT–NH2-3´ (pDNA)的电泳对比图。图B. 本产品(AppDNA)与ssRNA使用T4 RNA ligase 2 (T4 Rnl2), truncated的连接效果图。图中可见本产品与ssRNA有非常高的连接效率。

    本产品的寡核苷酸序列是:5´-rAppCTGTAGGCACCATCAAT–NH2-3´。本产品的序列同NEB公司的S1315S Universal miRNA Cloning Linker。

    本产品以水溶液的形式存在,浓度为40ng/µl,即6.9µM。

    用途:本产品可以应用于小RNA克隆、miRNA文库构建。

    本产品的1µg小包装约通常可以进行8-17次连接反应,5µg中包装约通常可以进行40-85次连接反应。具体的连接反应次数和反应体系的体积和本产品的用量有关。

    包装清单:

    产品编号 产品名称 包装
    R0702S Universal miRNA Cloning Linker (40ng/µl) 1µg
    说明书 1份

     

    产品编号 产品名称 包装
    R0702M Universal miRNA Cloning Linker (40ng/µl) 5µg
    说明书 1份

    保存条件:

    -20℃保存,一年有效。-80℃保存,至少一年有效。

    注意事项:

    本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

    为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

    使用说明:
    1.使用本产品与ssRNA的3’羟基末端连接推荐使用T4 TNA Ligase 2, truncated。也可以使用T4 TNA Ligase 2, truncated,K227Q,或T4 TNA Ligase 2, truncated,T4 TNA Ligase 2, truncatedKQ (R55K, K227Q)。
    2.参考下表在冰浴中配制如下反应体系:

    Reagent Volume Final Concentration
    ssRNA xµl 0.5µM
    DEPC-treated Water (1.1 or 2.55)-xµl -
    Universal miRNA Cloning Linker (6.9pmol/µl) 2.9 or 1.45µl 1 or 0.5µM
    PEG8000 (50%, RNase Free) 12µl 0.3
    10X Reaction Buffer 2µl 1 X
    RNase Inhibitor (40U/μl) 1µl 2U/μl
    T4 RNA Ligase2, truncated (200U/µl) 1µl 10U/µl -
    Total Volume 20µl -

    注意:
    a.由于涉及RNA操作,需要严格按照RNA操作的规范进行,避免RNase污染,相关试剂和耗材需要经过DECP处理去除RNase或者确保是RNase free的。推荐在连接体系中添加RNase Inhibitor,以避免ssRNA或其连接产物的降解,尽管经测试我们发现在严格操作的情况下,不加RNase Inhibitor也不会导致ssRNA或其连接产物发生明显降解。
    b.进行连接反应时,如果样品RNA比较珍贵,希望充分被连接,可以按照接头和样品RNA的摩尔比为2:1的比例进行连接;如果样品RNA比较充裕,同时感觉本产品的成本偏高时,可以按照接头和样品RNA的摩尔比摩尔比1:1甚至1:2的比例进行连接反应,这样可以很好地节省本产品。
    c.如果同时进行多个连接反应,可以把上表中除ssRNA之外的所有溶液和酶提前预混合,然后再分装到各反应管内。
    3.连接反应:25℃, 孵育60min。为了使连接反应更加充分,可以适当延长连接反应时间。
    4.终止反应:65℃,孵育15min。

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