重组质粒的转化及阳性克隆的鉴定

点击次数:782次     发布时间:2021/12/8 10:50:24

 1材料
    E.coliJM109菌株
    2仪器、用具
    超净工作台、离心机、恒温摇床、恒温培养箱、培养皿、试管、1.5ml离心管、电泳仪、电泳槽、凝胶样品梳、移液器
    3试剂
    (1)CaCl2、LB平板(见附录);SOC培养基(见附录);SOB培养基
    (2)RNaseA1;BufferS1;BufferS2;BufferS3;BufferW1;无水乙醇的BufferW2a
    (3)1×电泳缓冲液(TAE);溴化乙锭溶液(EB)[有毒,小心];琼脂糖;6×加样缓冲液
    (4)酚;
    (5)ddH2O;10×PCRBuffer(Mg2plus);dNTP;M13;M13-;TaKaRarTaq酶
    4方法
    1.大肠杆菌感受态细胞的制备
    (1)取大肠杆菌JM109保存液50μl,接种于4mlLB(或SOB)液体培养基中,37℃,300rpm振荡培养过夜,第二天取50μl转接到新的4mlLB(或SOB)液体培养基中扩大培养3h至OD600=0.35~0.4,在无菌操作台上取1ml菌液于1.5ml离心管中,冰浴10min。
    (2)4℃,5000rpm离心2min,去上清液。
    (3)加入750μl预冷的0.1MCaCl2重悬菌体,冰浴30min。
    (4)4℃,5000rpm离心2min,弃上清液。
    (5)加入100μl冰冷的0.1MCaCl2轻轻重悬菌体,冰浴2h后,4℃保存备用。
    2.重组DNA的转化
    (1)将含Amp、X-Gal、IPTG的LB平板37℃预热。
    (2)于100μl感受态细胞中加入10μl连接产物,冰浴30min。
    (3)将离心管转入42℃水浴,热冲击90秒,然后不要摇动离心管,迅速将其放在冰上2min。
    (4)在离心管中加入SOC培养基300μl,枪头混匀,37℃、150rpm温和摇振60min。
    (5)将200μl转化菌液均匀地涂布于含50mg/mlAmp、20mg/mlX-gal、200mg/mlIPTG的LB平板上,37℃倒置培养过夜,挑选白色菌落进行鉴定。
    注意事项:
    ①制备感受态细胞的全部操作均须于冰浴操作,同时注意近火无菌操作,防止感受态细胞受杂菌污染。
    ②42℃热处理时很关键,转移速度要快,且温度要准确。
    ③菌液涂皿操作时,应避免反复来回涂布,因为感受态细菌的细胞壁有了变化,过多的机械挤压涂布会使细胞破裂,影响转化率。
    3.重组质粒的鉴定
    方案一菌落PCR
    (1)制备PCR混合液:
    (2)用经灭菌的10μl枪头(不用牙签)挑去白色菌落,迅速地使挑取物溶在上述混合液中。
    (3)盖上离心管得盖子,在沸水上温育10min。
    (4)将步骤⑶的样品冷却至室温,离心数秒,然后于管中加入TaKaRarTaq酶0.25ul。
    (5)按以下条件进行PCR反应:94℃预变性3min;然后进行30个循环反应,其温度循环条件为:94℃变性1min,57℃退火1min,72℃延伸1min;循环结束后72℃再延伸5min。
    (6)取5μlPCR产物在1%琼脂糖凝胶上进行电泳检测。
    方案二质粒PCR
    1.碱裂解法少量制备质粒DNA
    (1)用离心管收集4ml在LB培养基(含Amp)中培养过夜的菌液,14000rpm离心30秒,弃尽上清。
    (2)用250μl已加入RNaseA1的BufferS1充分悬浮细菌沉淀。
    (3)加入250μlBufferS2,温和但充分地上下翻转混合4-6次,此步骤不宜超过5min。
    *BufferS2使用后应立即盖紧瓶盖,以免空气中的CO2中和BufferS2中的NaOH,降低溶菌效率。
    (4)加入400μlBufferS3,温和地上下翻转8-10次,室温静置2min,14000rpm离心10min。
    *若离心后凝结块未沉淀到离心管底部,应再上下翻转数次,12000g离心3min。
    (5)将DNA-prepTube置于2-mlMicrofugeTube中,将步⑷中的混合液移入DNA-prepTube中,5500rpm离心1min。
    (6)弃滤液,将DNA-prepTube置回到原2-mlMicrofugeTube中,加入500μlBufferW1,5500rpm离心1min。
    (7)弃滤液,将DNA-prepTube置回到原2-mlMicrofugeTube中,加入700μl已加无水乙醇的BufferW2,5500rpm离心1min,以同样的方法再用700μl已加无水乙醇的Buffer
    W2洗涤一次。
    (8)弃滤液,将DNA-prepTube置回到原2-mlMicrofugeTube中,14000rpm离心1min。

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