1. 产品概述
-
基因名称:SMPX(Small Muscle Protein, X-linked)
-
技术方法:采用 CRISPR-Cas9 基因编辑技术,确保高效、精准的基因敲除。
-
细胞类型:可根据需求选择 HEK293、HCT116、HeLa 等常见细胞系,或定制原代细胞敲除112。
-
验证方式:
-
基因组水平:PCR + Sanger测序确认基因敲除(Indel或大片段缺失)。
-
蛋白水平:Western Blot(WB)检测SMPX蛋白表达缺失(需使用特异性抗体)。
-
脱靶分析(可选):NGS测序检测潜在脱靶位点113。
-
2. 产品优势
-
高敲除效率:采用 双gRNA策略,敲除效率可达 90%以上1。
-
严格质控:细胞株经过 支原体检测、单克隆验证、稳定性测试(>20代)115。
-
配套服务:提供 野生型对照细胞 和 技术支持(如WB检测建议)1。
3. 适用研究领域
-
肌肉疾病研究(SMPX与X-linked肌病相关)。
-
听觉功能研究(SMPX在内耳毛细胞中表达)。
-
基因功能与信号通路研究。
二、SMPX基因敲除细胞株操作步骤
1. 细胞复苏与培养
-
快速解冻:从液氮中取出冻存管,37℃水浴融化,加入预热的完全培养基(含10% FBS)。
-
离心去DMSO:1000 rpm离心5分钟,弃上清,重悬于新鲜培养基。
-
培养扩增:接种于T25培养瓶,37℃、5% CO₂培养,观察细胞贴壁情况(贴壁细胞)或悬浮生长(悬浮细胞)。
2. 基因敲除验证
(1) 基因组DNA提取
-
使用 基因组提取试剂盒 提取细胞DNA。
-
PCR扩增SMPX靶区域(设计引物覆盖gRNA切割位点)。
(2) Sanger测序
-
送测PCR产物,分析测序峰图,确认 插入/缺失(Indel) 或 大片段缺失(若采用双gRNA策略)13。
(3) Western Blot验证
-
提取细胞总蛋白,使用 SMPX特异性抗体(如Abcam #xxxxx)检测蛋白表达是否消失16。
-
注意:若仍有残留信号,可能是 可变剪接导致截短蛋白,需重新设计gRNA靶向关键外显子16。
3. 细胞冻存与保种
-
收集对数期细胞,计数后调整至 5×10⁶ cells/mL。
-
使用 冻存液(90% FBS + 10% DMSO) 分装至冻存管。
-
程序降温:4℃ 30min → -20℃ 2h → -80℃过夜 → 液氮长期保存15。
三、常见问题与解决方案
问题 | 可能原因 | 解决方案 |
---|---|---|
WB检测到残留蛋白 | 可变剪接 / 移码突变未完全破坏ORF | 改用 大片段敲除策略 或靶向多个外显子16 |
敲除效率低 | gRNA活性不足 / 细胞转染效率低 | 更换高活性gRNA / 优化电转条件13 |
细胞生长异常 | SMPX为必需基因 / 脱靶效应 | 使用 可诱导型Cas9 或进行 救援实验(Rescue)12 |
四、商业化服务推荐